La Junta de Govern del Fons Menorquí està formada per representants dels ajuntaments de l'illa, del Consell Insular i dels Govern Balear, així com de nou ONGD. La darrera renovació es va realitzar el 3 d'agost de 2021.
La presidència s'elegeix de manera rotatòria entre els ajuntaments cada dos anys. I cap representant de la Junta de Govern de l'entitat perceb remuneració econòmica per ostentar el càrrec.
Les tasques de representació i gestió derivades dels acords de la Junta de Govern són executades pel Comité Executiu.
Les persones membres de l'actual Junta de Govern són :
- Presidència: Martín Riera Riera. Regidor de l'Ajuntament des Mercadal
- Secretaria: Francisco Mercadal Pons, representant de Fundació Vicent Ferrer
- Vicepresidència primera: Susana Mora Humbert, presidenta del Consell Insular de Menorca (PSOE)
- Vicepresidència segona: Laura Celià Gelabert, Directora General de Cooperació del Govern (Més)
- Vocalies:
- Antonia Camps Florit, batlessa des Migjorn Gran
- Antoni Jesús Carrillo Cantó, regidor de l'Ajuntament de Maó
- Maria Antonia Pons Mascaró, regidora de l'Ajuntament d'Alaior
- Maite Martínez Martínez, regidora de l'Ajuntament de Sant Lluís
- Marisa Álvarez Guasch, regidora de l'Ajuntament des Castell
- Antoni Salord Febrer, regidor de l'Ajuntament de Ferreries
- Carla Gener Marquès, regidora de l'Ajuntament de Ciutadella
- Magdalena Cardona Cardona, representant de l'Associació d'Amics del Poble Sahrauí de Menorca
- Antònia Florit Salord, representant de l'associació Entrepobles
- Jaume Fabregat Mestre, representant de l'associació STEI Intersindical
- Leonor Hernández Pons, representant de l'associació Apotecaris Solidaris
- Raquel Hernández Sosa, representant de Càritas
- Catalina Seguí de Vidal, representant de Mans Unides
- Bartomeu Pons Huguet, representant de Creu Roja
Les persones que composen el Comitè Execitiu són:
- Presidència: Martín Riera Riera. Ajuntament des Mercadal
- Secretaria: Francisco Mercadal Pons, representant de la Fundació Vicent Ferrer
- Vicepresidència primera: Susana Mora Humbert, presidenta del Consell Insular de Menorca (PSOE)
- Vocalies: Francisco Mercadal Pons, batle des Mercadal, i Bartomeu Pons Huguet, representant de Creu Roja.
Organigama
